Estudo in silico de fitoquímicos na região Receptor-Binding Domain (RBD) da proteína spike do SARS-CoV-2 (variante Ômicron, B.1.1.529)

COVID-19 é uma doença altamente contagiosa causada pelo coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) tornando-se grande ameaça em todo o mundo devido à sua rápida natureza de disseminação e variantes mais agressivas, como caso Ômicron. A principal estrutura interação do vírus com a célula hospedeira região pico proteína Spike chamada RBD, que teve diversas mutações, dificultando busca fármacos. Com base nesse cenário, presente trabalho objetivo avaliar perfil interações entre moléculas origem naturais frente RBD (S) SARS-CoV-2, variante Na primeira etapa metodológica ocorreu modelagem molecular sequência obtida no Brasil testes para caracterização validação estrutural. Em seguida, foi realizado docking 6 ligantes fitoquímicos: Curcumina, Carvacrol (±)-Limoneno, Glicirrizina, Alicina Quercetina-3-Arabinoside na específica modelada, após obter os melhores resultados, complexos formados foram avaliados por RMSD RMSF. homologia obteve-se baixos erros estruturais. Nas cada fitoquímico, as glicirrizina quercetina apresentaram maior afinidade molecular, ligando-se ao sítio ativo encontrado RBD. dinâmica confirmou dos estabilidade durante simulações. um potencial molécula S, partir genoma ômicron inédita SARS-CoV-2 sequenciada Brasil.